Penyakit pada udang windu susah diidentifikasi jenis serangannya karena peternak tidak mempunyai pengetahuan tentang pencegahan penyakit sehingga akan berakibat pada menurunnya metabolisme udang yang menyebabkan kematian hingga gagal panen . Kemajuan sistem pakar dapat mengatasi permasalahan ini yaitu dengan merancang sebuah sistem komputer berbasis web yang terintegrasi dengan database dan bahasa pemrograman seperti PHP-MySQL sehingga dapat membantu peternak udang windu untuk mendiagnosa penyakit terserbut. Aplikasi sistem pakar dalam pengambilan keputusan ini menggunakan metode Bayes, dalam teori probabilitas dan statistika, teorema Bayes adalah sebuah teorema dengan dua penafsiran berbeda. Dalam penafsiran Bayes, teorema ini menyatakan seberapa jauh derajat kepercayaan subjektif harus berubah secara rasional ketika ada petunjuk baru. untuk mendapatkan hasil diagnosa.  Hasil dari implementasi sistem yaitu sistem memberikan pertanyaan berupa gejala-gejala yang harus dijawab oleh peternak berdasarkan gejala yang terserang udang dan hasil dari proses tersebut sistem akan  memberikan informasi penyakit apa yang dialaminya guna mendapatkan alternative dengan pengobatan dan pencegahan.

Kata Kunci : Sistem Pakar, Penyakit Udang Windu, Diagnosa, PHP-MySQL, Bayes