Penyakit tiroid adalah salah satu gejalanya ditandai dengan kelenjar yang berbentuk kupu-kupu yang terletak pada bawah pangkal tenggorokan. Gejala dan tanda penyakit tiroid ini adalah gondok biasa, tiroid atau kelenjar yang membesar yang akhirnya menyebabkan leher terlihat membengkak. Kemajuan sistem pakar dapat mengatasi permasalahan ini yaitu dengan merancang sebuah sistem komputer berbasis web yang terintegrasi dengan database dan bahasa pemrograman seperti PHP-MySQL sehingga dapat membantu penderita penyakit Tiroid untuk mendiagnosa penyakit terserbut. Sistem pakar dalam pengambilan keputusannya menggunakan mesin inferensi seperti Certainty Factor yang dapat mengambil keputusan suatu penyakit berdasarkan hasil diagnosa.  Hasil dari implementasi sistem yaitu sistem yaitu diberikan pertanyaan gejala-gejala yang harus dijawab oleh pasien berdasarkan gejala yang dialami penderita penyakit Tiroid dan hasil dari proses tersebut sistem akan  memberikan informasi penyakit apa yang dialaminya guna mendapatkan solusi pengobatan dan obat apa yang digunakan sehingga akan sangat membantu menghemat biaya pengobatan bagi penderita. Hasil diagnosa dari sistem dapat mendiagnosa jenis penyakit tiroid seperti Tiroid Folikuler, Tiroid Anaplastik, Tiroid Papiler dan Tiroid meduler.

Kata Kunci : Sistem Pakar, Gejala, Penyakit Tiroid, Diagnosa, PHP-MySQL, Certainty Facktor, Pasien